Nörodejeneratif Araştırmaların Geleceği Veri Birlikte Çalışabilirliğine Bağlıdır
Özet
ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık., Alzheimer ve Parkinson gibi nörodejeneratif hastalıkNörodejeneratif HastalıkBeyin ve sinir sisteminin ilerleyici ve geri dönüşü olmayan hasarına neden olan hastalıklar grubudur.lar, ortak klinik semptomSemptomBir hastalığın veya durumun belirtisi.ların ardında gizlenen biyolojik alt tiplerin bir araya gelmesiyle oluşur. Araştırmacılar, hasta alt popülasyonlarındaki temel nedenleri anlamak için, genomik, transkriptomTranskriptomBir hücre veya dokuda belirli bir zamanda sentezlenen tüm RNA moleküllerinin (mRNA, tRNA, rRNA vb.) tamamı.ik, görüntüleme ve klinik fenotipKlinik FenotipBir hastalığın genetik yapısının dışa vuran, gözlemlenebilir fiziksel, işlevsel ve klinik özelliklerinin tamamı.leri kapsayan geniş ölçekli verilere ihtiyaç duyarlar. Veri birlikte çalışabilirliğinin sağlanması, günümüzün önemli altyapı sorunlarından biridir.
ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık., Alzheimer ve Parkinson gibi nörodejeneratif hastalıkNörodejeneratif HastalıkBeyin ve sinir sisteminin ilerleyici ve geri dönüşü olmayan hasarına neden olan hastalıklar grubudur.lar, tek bir hastalık değildir; ortak klinik semptomSemptomBir hastalığın veya durumun belirtisi.ların ardında gizlenen biyolojik alt tiplerin bir araya gelmesidir. Bir ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. tanısı, motor nöron dejenerasyonuMotor Nöron Dejenerasyonuİstemli kas hareketlerini kontrol eden sinir hücrelerinin zamanla işlevini kaybetmesi ve yıkıma uğraması süreci.na yol açan farklı moleküler yolların herhangi birinden kaynaklanabilir. Hasta alt popülasyonlarındaki temel nedenleri gerçekten anlamak için, araştırmacıların geleneksel biyomedikal araştırmaların nadiren başarabildiği ölçekte verilere erişmesi gerekir. Sinyali gürültüden ayırmak için genomik, transkriptomTranskriptomBir hücre veya dokuda belirli bir zamanda sentezlenen tüm RNA moleküllerinin (mRNA, tRNA, rRNA vb.) tamamı.ik, görüntüleme, klinik fenotipKlinik FenotipBir hastalığın genetik yapısının dışa vuran, gözlemlenebilir fiziksel, işlevsel ve klinik özelliklerinin tamamı.ler ve uzunlamasınaUzunlamasınaAynı bireylerin zaman içinde birden fazla noktada takip edildiği ve verilerin toplandığı bir çalışma tasarımı. sonuçları kapsayan binlerce, hatta on binlerce hasta veri kümesi gereklidir.
On yıllardır, bu alan silolar halinde faaliyet gösterdi; bireysel laboratuvarlar, kurumlar ve hatta ülkeler bağımsız olarak çalıştı. Bu model, daha önceki bir dönemde mantıklıydı, ancak bugün yapısal bir darboğazı temsil ediyor. Sonuç, büyük ve küçük veri kümelerinin küresel bir yamasıdır. Bu veri kümelerinin çoğu, tek tek bilimsel olarak yetersizdir, ancak toplu olarak dönüştürücü olabilirler. Bu biriken veri kümelerinin birlikte çalışabilirliğinin sağlanması, zamanımızın önemli bir altyapı sorunudur.
Bunu fark eden alan, değişmeye başladı. Veri kümelerini merkezi, bulut tabanlı depolara toplamak için büyük ölçekli girişimler ortaya çıktı. Bu çabalar, veri sahipliği, gizlilik ve rekabet konusundaki önemli kültürel ve kurumsal engellerin aşılmasını gerektirdi. Gerçek ilerlemeyi temsil ediyorlar ve şimdiden her zamankinden daha sağlam analizler sağlıyorlar. Bunun gerçekten güzel bir örneği, akademi, kar amacı gütmeyen kuruluşlar ve biyoteknoloji şirketlerinden geniş, yüksek kaliteli klinik veri kümelerinin bir koleksiyonunu barındıran ve Target ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. Global Doğal Tarih Çalışması Verilerini içeren AMP-ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. Bilgi portalının yakın zamanda başlatılmasıdır.
Ancak toplama, birlikte çalışabilirlik ile aynı şey değildir.
Verileri fiziksel olarak tek bir depoya taşımak maliyetli, zaman alıcı ve genellikle kırılgan bir çözümdür. Veri paylaşım anlaşmalarının yürütülmesi 3 aydan bir yıla kadar sürebilir. Büyük veri kümelerinin aktarılması önemli bir altyapı gerektirir ve hata, veri kaybı veya meta verilerin bozulması için fırsatlar yaratır. Özellikle Amerika Birleşik Devletleri'ndeki HIPAA ve Avrupa'daki GDPR gibi çerçeveler altında gizlilik endişeleri, özellikle sınır ötesi veri paylaşımı için daha fazla karmaşıklık ekler. Veriler başarıyla merkezileştirildiğinde bile, biçimlendirme, terminoloji ve ölçü birimlerindeki tutarsızlıklar kullanılabilirliğini sınırlayabilir. Yakın zamanda, Target ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık., Michael J Fox Vakfı ve büyük veri kümelerinin diğer bazı özel finansörleri, FAIR veri prensiplerini (Bulunabilirlik, Erişilebilirlik, Birlikte Çalışabilirlik ve Yeniden Kullanılabilirlik) tartışmak için bir araya geldi. Çalıştayın sonucu yakın zamanda Journal of Parkinson's Disease'de yayınlandı ve verilerimizi diğer büyük veri kümeleriyle uyumlu hale getirmek için eşleme yaklaşımları geliştirmek üzere devam eden işbirliğine yol açtı ve veri kümeleri arasında federasyon öğrenimini destekledi.
Veri bulunabilirliğini, erişilebilirliğini ve birlikte çalışabilirliğini artırmak için Target ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. Veri Motoru, araştırmacıların hassas verileri taşımak zorunda kalmadan tek, birleşik standartlara uyumlu bir arayüz aracılığıyla nadir ve nörodejeneratif hastalıkNörodejeneratif HastalıkBeyin ve sinir sisteminin ilerleyici ve geri dönüşü olmayan hasarına neden olan hastalıklar grubudur.lar genelinde geniş genomik ve çoklu-omik veri kümelerini keşfetmelerini ve erişmelerini sağlayan DNAstack'in Omics AI platformu tarafından desteklenmektedir. Federasyon sistemlerinin, uyumsuz formatlarda farklı sistemlerde bulunan eski veri kümelerinin bulunduğu geriye dönük olarak değil, veri kümelerinin birlikte çalışabilirlik göz önünde bulundurularak oluşturulduğu durumlarda ileriye dönük olarak uygulanması genellikle daha kolaydır. Bu senaryoda, bilim insanları, makine öğrenimi algoritmalarının dağıtılmış veri kümelerine gönderildiği, güvenli bir şekilde eğitildiği ve ardından ham verileri taşımadan küresel modellere toplandığı federasyon öğrenimi yaklaşımlarına yöneliyorlar. Flower.ai gibi gruplar, federasyon öğrenimi için altyapı sağlamak üzere endüstriyel sınıf uygulamalar geliştiriyor.
Bu yaklaşımlar, anlamlı bir ileri adımı temsil ediyor. Sürtünmeyi azaltır, gizliliği artırır ve daha önce pratik olmayan şekillerde verileri ölçekte kullanmayı mümkün kılar. Bu, veri paylaşımı ve birlikte çalışabilirliğin mekaniğine kısa bir derinlemesine bakış olsa da, bu analizlerin, geleneksel veya ML tabanlı anlamlı çıktısının, kullanılan verilerin kalitesine dayandığını vurgulamak önemlidir. Bu hedefle uyumlu olarak, Target ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık.'nin ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. Küresel Araştırma Girişimi, her kökenden, etnik kökenden ve coğrafi bölgeden insanlardan kapsamlı, çok modlu veri kümeleri oluşturmak üzere tasarlanmıştır. Bu veriler Target ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. Veri Motoru'nda bulunabilir ve önümüzdeki 5 yıl içinde 6000 katılımcıya ulaşma hedefiyle sürekli olarak güncellenecektir. Bu verilerden ve nörodejeneratif hastalıkNörodejeneratif HastalıkBeyin ve sinir sisteminin ilerleyici ve geri dönüşü olmayan hasarına neden olan hastalıklar grubudur. genelindeki diğer büyük veri kümeleriyle birlikte çalışabilirlikten gelecek yeni atılımları dört gözle bekliyoruz.