New York Genome Center ALS Konsorsiyumu: Postmortem Transkriptomik ve Tüm Genom Dizilemesinin Entegrasyonu ile Biyolojik Keşifler

Doktor Özeti: Bu çalışma, ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık.'nin genetik ve klinik heterojenHeterojenÇeşitli bileşenlerden veya öğelerden oluşan; tıpta, birden fazla nedeni veya klinik sunumu olan bir hastalık veya durum için kullanılır.liğini aydınlatmak amacıyla New York Genom Merkezi (NYGC) ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. Konsorsiyumu tarafından sunulan kapsamlı bir multi-omikMulti-omikGenomik, metabolomik ve proteomik gibi farklı biyolojik veri setlerinin birleştirilerek kapsamlı bir analiz yapılması yöntemi. veri setini tanıtmaktadır. Çalışmada, 4.746 donörden elde edilen tüm genom dizileme (WGS) verileri ile ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. spektrumundaki 695 donörün 8 farklı beyin ve omurilik bölgesinden alınan 2.574 postmortemPostmortemÖlüm sonrası; bir organizmanın ölümünden sonra gerçekleştirilen tıbbi inceleme veya işlemler. doku örneğinin bulk RNA-seqRNA-SeqRNA dizileme, bir RNA örneğindeki nükleotid dizisini belirleme işlemidir. Gen ekspresyonunu incelemek için kullanılır. verileri entegre edilmiştir. Yapılan varyantVaryantBir genin veya DNA dizisinin popülasyonda görülen, normalden farklı olan bir versiyonu veya formu. Genetik varyantlar hastalık riskini veya seyrini etkileyebilir. analizleri (küçük varyantVaryantBir genin veya DNA dizisinin popülasyonda görülen, normalden farklı olan bir versiyonu veya formu. Genetik varyantlar hastalık riskini veya seyrini etkileyebilir.lar, yapısal varyantVaryantBir genin veya DNA dizisinin popülasyonda görülen, normalden farklı olan bir versiyonu veya formu. Genetik varyantlar hastalık riskini veya seyrini etkileyebilir.lar ve kısa tandem tekrarları), ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. vakalarının %15,6'sında muhtemel patojenik mutasyonlarPatojenik mutasyonlarBir hastalığa neden olan veya hastalığın gelişimine katkıda bulunan genetik değişiklikler.ı ortaya koymuştur. 5 ana dokuda gerçekleştirilen gen ekspresyonuGen EkspresyonuBir genin bilgisinin işlevsel bir ürün (protein veya RNA) sentezlemek için kullanıldığı süreç. ve mRNA splicing analizleri, omurilikte özellikle mikroglial ve T-hücresi disregülasyonDisregülasyonBir biyolojik sistemin veya mekanizmanın normal işleyişinin bozulması, düzenlenememesi durumu.unu vurgulayan bölgeye özgü ve ortak transkriptomTranskriptomBir hücre veya dokuda belirli bir zamanda sentezlenen tüm RNA moleküllerinin (mRNA, tRNA, rRNA vb.) tamamı.ik özellikleri tanımlamıştır. Ekspresyon ve splicing süreçlerinin genetik regülasyonunun haritalanması (eQTL/sQTL), 6 ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. risk lokusu ile anlamlı ilişkiler göstermiştir. Bu açık erişimli veri seti, ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. patofizyolojiPatofizyolojiBir hastalığın veya durumun vücutta neden olduğu işlevsel değişiklikleri ve mekanizmaları inceleyen bilim dalı.sinin çözülmesi ve yeni terapötik hedefTerapötik HedefBir hastalığın tedavisinde, ilacın etki etmesi için seçilen spesifik bir molekül, gen veya metabolik yolak.lerin belirlenmesi için benzersiz bir klinik-biyolojik kaynak sunmaktadır.

Önemli Bulgular: NYGC ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. Konsorsiyumu, 4.746 donörün tüm genom dizilemesini ve 695 donörün postmortemPostmortemÖlüm sonrası; bir organizmanın ölümünden sonra gerçekleştirilen tıbbi inceleme veya işlemler. beyin/omurilik dokularından elde edilen RNA-seqRNA-SeqRNA dizileme, bir RNA örneğindeki nükleotid dizisini belirleme işlemidir. Gen ekspresyonunu incelemek için kullanılır. verilerini birleştiren devasa bir açık erişimli kaynak sunmaktadır. Genetik analizler (küçük varyantVaryantBir genin veya DNA dizisinin popülasyonda görülen, normalden farklı olan bir versiyonu veya formu. Genetik varyantlar hastalık riskini veya seyrini etkileyebilir.lar, yapısal varyantVaryantBir genin veya DNA dizisinin popülasyonda görülen, normalden farklı olan bir versiyonu veya formu. Genetik varyantlar hastalık riskini veya seyrini etkileyebilir.lar ve kısa tandem tekrarları), ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. vakalarının %15,6'sında muhtemel patojenik mutasyonlarPatojenik mutasyonlarBir hastalığa neden olan veya hastalığın gelişimine katkıda bulunan genetik değişiklikler. tespit etmiştir. Doku bazlı transkriptomTranskriptomBir hücre veya dokuda belirli bir zamanda sentezlenen tüm RNA moleküllerinin (mRNA, tRNA, rRNA vb.) tamamı.ik analizler, özellikle omurilik bölgesinde mikroglia ve T-hücresi kaynaklı immün disregülasyonDisregülasyonBir biyolojik sistemin veya mekanizmanın normal işleyişinin bozulması, düzenlenememesi durumu.u işaret etmektedir. Gen ekspresyonuGen EkspresyonuBir genin bilgisinin işlevsel bir ürün (protein veya RNA) sentezlemek için kullanıldığı süreç. ve mRNA splicing haritalaması, 6 farklı ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. risk lokusu ile doğrudan ilişkilendirilmiştir.